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動物科技學(xué)院辦學(xué)歷史悠久，淵源于1917年南京高等師范所設(shè)農(nóng)科，是國內(nèi)最早設(shè)立的一個畜牧獸醫(yī)高等教育單位。1921年在南京高等師范的基礎(chǔ)上成立的東南大學(xué)正式設(shè)立畜牧系，1927年東南大學(xué)更名為中央大學(xué)，新中國成立后中央大學(xué)更名為南京大學(xué)。1952年全國高等院校調(diào)整成立南京農(nóng)學(xué)院，由原南京大學(xué)農(nóng)學(xué)院的畜牧獸醫(yī)系和浙江大學(xué)農(nóng)學(xué)院的畜牧獸醫(yī)系合并成立南京農(nóng)學(xué)院畜牧獸醫(yī)系，分設(shè)畜牧、獸醫(yī)兩個專業(yè)。1983年畜牧獸醫(yī)系分開，成立畜牧系和獸醫(yī)系。1994年畜牧系更名為動物科學(xué)系，1996年正式成立動物科技學(xué)院。

    學(xué)院設(shè)有動物遺傳育種與繁殖系、動物營養(yǎng)與飼料科學(xué)系、特種經(jīng)濟(jì)動物與水產(chǎn)系、實驗教學(xué)中心（國家級示范）和農(nóng)業(yè)部牛冷凍精液質(zhì)量監(jiān)督檢驗測試中心?，F(xiàn)有教職工109人，專任教師84人，教授28名，副教授26名，博導(dǎo)22名，碩導(dǎo)44名；國務(wù)院“政府特殊津貼”2人；國家杰青1人、“973”首席科學(xué)家1人、現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系崗位科學(xué)家2人、國家優(yōu)青1人；教育部新世紀(jì)人才1人、青年骨干教師3人；江蘇省“六大高峰人才” 1人、333人才工程培養(yǎng)對象3人、青藍(lán)工程中青年學(xué)術(shù)帶頭人2人、骨干教師培養(yǎng)計劃2人、教學(xué)名師1人；南京農(nóng)業(yè)大學(xué)鐘山新秀5人；“新中國60年畜牧獸醫(yī)科技貢獻(xiàn)獎（杰出人物）” 1人。

    擁有畜牧學(xué)、水產(chǎn)一級學(xué)科博士點(diǎn)和1個博士后流動站，4個二級博士點(diǎn)、4個二級碩士點(diǎn)，皆為省重點(diǎn)學(xué)科。本科有動物科學(xué)、水產(chǎn)養(yǎng)殖、動物健康與生產(chǎn)強(qiáng)化班（共建），動物科學(xué)為教育部和江蘇省特色專業(yè)。在校本科生600余名，研究生400余名。

    建有動物科學(xué)類國家級實驗教學(xué)示范中心，農(nóng)業(yè)部動物生理生化重點(diǎn)實驗室（共建）；江蘇省消化道營養(yǎng)與動物健康、動物源食品生產(chǎn)與安全保障、水產(chǎn)動物營養(yǎng)、家畜胚胎工程省級實驗室4個；肉羊產(chǎn)業(yè)省級工程技術(shù)中心1個、校企共建省級工程中心2個；國家級精品課程2門、視頻公開課1門、資源共享課2門；目前，承擔(dān)國家、部省級課題80多項，主持973一項。近年來，獲得國家科技進(jìn)步二等獎2項（參加單位）、國家教育教學(xué)成果獎二等獎1項、省部級科技獎8項，國家專利20余項。實施卓越農(nóng)林人才教育培養(yǎng)計劃改革試點(diǎn)專業(yè)。與國內(nèi)10多家知名企業(yè)建立緊密合作關(guān)系，每年獎學(xué)、獎教金達(dá)70余萬元。

    注重國際交流及合作，先后與美國、英國、法國、德國、丹麥、加拿大、澳大利亞、荷蘭、日本等國20多所大學(xué)建立合作關(guān)系。7所國外高校與學(xué)院建立了聯(lián)合辦學(xué)項目，如中美“1+2+1”本科雙學(xué)位、澳大利亞墨爾本大學(xué)“2+1.5”本科雙學(xué)位、加拿大曼尼托巴大學(xué)本科雙學(xué)位、荷蘭瓦赫寧根大學(xué)研究生、韓國國立慶北大學(xué)學(xué)生交換等。

    學(xué)院在百年的發(fā)展歷史中，動物科學(xué)各領(lǐng)域取得了一批豐碩的部省級以上教學(xué)和科研成果，為國家培養(yǎng)了3000多名本科生與研究生，其中包括中國工程院院士任繼周和劉守仁在內(nèi)的一大批高級專門人才。